どんなことにおいてもメリットの反面、デメリットも存在します。運用管理も例外ではなく、デメリットをわかってこそ、本質を理解できるといえます。
運用管理の活用を行なう場合、まず、メインとなるシステムを構築していくことになります。これは、運用管理のシステムと同時に作り上げていくことになります。専門的な知識や技術が必要な作業となります。構築するシステムの大きさにより、作業は変わってくるといえます。一人でできる場合もあれば、そうでない場合もありえます。システムを構築していくまでに、試行錯誤を繰り返していくのです。
メインとなるシステムが構築され、同時に運用管理システムの構築もひとまず終えたとします。その後に行なわれることは、試験的にそのシステムを稼働させるのです。これにより、トラブルや不具合を見極めるのです。もちろん構築段階でもあらゆるトラブルや不具合を想定しています。しかし実際に試験運用をしてみると、考えつかない問題点が生じる可能性があるのです。数度となく行なう試験運用で、互いのシステムを合わせるといえます。
試験運用を終え、問題点を改善したら実運用と言う形になります。しかし、実際にシステムを稼働しても、トラブルや不具合が発生することはありえます。その原因はさまざまです。人為的なものである可能性もありますし、コンピュータ内部の問題かもしれません。もし、システムの稼動時のトラブルでは、運用管理システムが正常に働いていれば、問題に対処することができ、業務に戻ることが可能となはずです。